「我們已取得平息暴亂的第一步勝利。」1989年6月5日，清晨6點半，北京中央電台廣播一份聲明，宣告已控制住天安門的局勢；這份〈告全體共產黨員和全國人民書〉，正是由江澤民所起草；內容還說道：「暴亂份子是絕不會甘心失敗的，他們還會伺機反撲…」事實上，當日在廣場之外的街道，還有零星衝突與示威反抗——在北京長安街上，有一位身分不明的男子，隻身阻擋在一列坦克車前。
5日的凌晨時分，天安門廣場的清場已基本完成。但戒嚴部隊仍在北京全市執行任務，而且由於廣場外的主要交通幹道線，仍被示威抗議民眾和路障阻擋，為了完全控制住整個北京的局勢，部隊依舊全副武裝繼續挺進。
各路口與街道除了被發現的傷亡者，許多被武力鎮壓所激怒的民眾，轉為向軍隊抵抗。根據當時的實錄側記，有人高呼「血戰到底」、有人反向襲擊部隊官兵；同樣的，部隊「強硬手段、堅決反擊」的指令不變，所以即便到清場後的6月5日，坦克與槍響仍未止息。
當天在東長安街方向，出現一名身分未明的男子，隻身阻擋在一列59式戰車車隊之前，攔阻坦克的去路。這一幕，由當時聚集在北京飯店的外國記者們目擊拍攝（清場後多數外國記者、包含港台在內，都聚集在此，而未能深入廣場），後來成為六四事件最為衝擊的代表照片「坦克人」（Tank Man），其真實身分與生死下落，也是至今仍未解開的謎團。
當戒嚴部隊強力鎮壓的同時，大批進駐的軍隊也同在面臨內部的騷動。從發布戒嚴以來陸續駐紮的官兵，到清場前夕時開始出現情緒極為不耐、部隊糧食不足的惡劣情形，幾度讓士氣受到打擊。
特別是下令執行任務後，影響更為明顯。有些集團軍在執行戒嚴任務時，忽視命令、主動繳械、甚至還差點出現兵變。例如第28集團軍，就未徹底執行中央「武力挺進」的命令，於木樨地一帶被民眾攔阻後就順勢停滯。得知軍隊向人民開火的官兵開始軍心渙散，還將領章軍帽丟下、棄車離去。28集團軍沒有主動阻止民眾燒毀軍車，最後還沒抵達目標地就撤離。
特意忽視命令的28集團軍，在六四之後遭到中央歷時半年調查整頓，許多軍官都被降職調離。
佔領建國門的第39集團軍第115師，其軍用卡車則被一輛高速行駛的裝甲車撞翻，導致眾多士兵受傷，混亂中有軍官呼叫「老子不幹了！」，還有士兵激憤棄械摔槍；被迫執行對人民開火的任務，使得這些軍官當下的情緒極為憤怒緊張，在指揮官與幹部分頭安撫之下，才防止差點出現的兵變。
「我們現在就向人民繳槍。」有一位解放軍連長，在4日率領兩輛軍用車，開進了北京師範大學裡。連長對現場的師生民眾說：
「…進城後看到的情景，讓我明白北京到底發生了什麼。…你們放心，我們是人民子弟兵，絕不會向愛國大學生和北京市民開槍。」
語畢，連長與官兵主動把槍械丟下，但民眾憂心這個舉動，反而會引發後續校園危機，還是將軍官送出了校園。
「現在政府瘋了，我們也被逼瘋了。」在北大、政法大學等校，有悲痛的學生回校發送黑紗布，揚言發動抬屍遊行，或要設置臨時的靈堂悼念死去的同胞。反抗的情緒還在、反擊的呼聲仍高，但至此已是北京的最後終局。
這是1989年6月5日，「天安門事件」過後的第1天。
到6日清晨還有部隊調派進城，圖中身穿白衣者為指揮官，正在向部隊講話。運動抗爭期間，身穿白衣的便衣軍警，一直是廣場上被警惕留心的對象。 圖／美聯社
